PMMU adalah lembaga pendidikan yang konsis terhadap pembinaan kaum santri (putra dan putri), meletakkan landasan tempat berpijak serta langkah-langkah praktis, akurat dan berkualitas sesuai tuntutan zaman. Dari landasan berpijak ini, PMMU memiliki kemampuan untuk menyesuaikan diri dengan program pendidikan sesuai perkembangan zaman, tidak kaku atau statis. Memang, landasan ini bisa terhambat jika di dalamnya terdiri dari pelaksana-pelaksana pendidikan yang tidak cakap dan kurang respon pada akselerasi zaman yang serba cepat, tanpa batas dan jarak.
Semboyan : ” didiklah muridmu untuk zamannya”, dan kaidah: “Pelihara dan pertahankanlah program yang masih baik, tetapi gunakanlah program baru yang lebih baik”.
Ilustrasi ini mendatangkan inspirasi untuk melahirkan visi dan misi PMMU. Visinya adalah Misbahul Ulum menjadi pusat pendidikan Islam yang melahirkan generasi muslim, mukmin yang shalih, konsisten dan berjiwa pejuang dalam usaha membumikan ajaran Islam, mampu menegakkan amar makruf nahi mungkar, menuju hidup bahagia dunia dan akhirat.
Sedangkan misinya adalah:
- Mendidik santri dengan bekal ajaran Islam yang meliputi aqidah, syariat dan akhlaq mulia sebagai syarat mutlak menuju umat terbaik (khair al-ummah)
- Mendidik santri dengan ilmu yang komprehensif yang mencakup: ilmu-ilmu keislaman, ilmu bahasa, ilmu pengetahuan alam dan matematika, serta ilmu pengetahuan sosial dan keterampilan yang bermanfaat untuk meraih sukses masa depan, sehingga mereka kelak menjadi ahli zikr dan ahli fikr dalam masalah agama, mampu menegakkan dakwah Islam melalui amar makruf dan nahi mungkar.
- Menyiapkan santri dan lulusan yang mampu masuk ke pendidikan tinggi dalam berbagai disiplin ilmu, sehingga mereka memiliki kemampuan yang optimal untuk menjadi pemimpin masa depan